環境省は、改正鳥獣法に基づく指定管理鳥獣捕獲等事業の推進に向けて、都道府県による科学的・計画的な鳥獣の管理を支援するため、統計手法を用いて、ニホンジカ（都府県単位）及びイノシシ（広域ブロック単位）について、平成24年度末までの個体数の推定等を実施した。その結果、ニホンジカについてはほとんどの都府県で増加傾向であり、イノシシについては広域ブロックによって傾向が異なるものの長期的には増加傾向であることが明らかになった。
　平成24年度末についてみると、全国（北海道を除く）のニホンジカの推定個体数は中央値約249万頭となり、増加傾向が続いていることが明らかになった。また、イノシシの推定個体数は中央値約89万頭となり、長期的には増加傾向であるものの、前年度からはほぼ横ばいであることが明らかになった。
　ニホンジカについて平成35年度までの個体数の推移について将来予測を実施したところ、個体数を半減するためには、現行の２倍以上の捕獲を行わなければならないことが明らかになった。【環境省】